MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Azobacteroides pseudotrichonymphae genomovar. CFP2 plasmid pCFPG1

Total Repeats: 520

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011564	TCA	2	6	13	18	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550320
2	NC_011564	TGA	2	6	59	64	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550320
3	NC_011564	ACA	2	6	94	99	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550320
4	NC_011564	TA	3	6	117	122	50 %	50 %	0 %	0 %	212550320
5	NC_011564	TTC	2	6	213	218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550320
6	NC_011564	AAAG	2	8	340	347	75 %	0 %	25 %	0 %	212550320
7	NC_011564	ATTAC	2	10	384	393	40 %	40 %	0 %	20 %	212550320
8	NC_011564	TCGTA	2	10	396	405	20 %	40 %	20 %	20 %	212550320
9	NC_011564	CTT	2	6	526	531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550320
10	NC_011564	AAAT	2	8	594	601	75 %	25 %	0 %	0 %	212550320
11	NC_011564	GAG	2	6	700	705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212550320
12	NC_011564	ACA	2	6	714	719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550320
13	NC_011564	A	7	7	730	736	100 %	0 %	0 %	0 %	212550320
14	NC_011564	AGC	2	6	848	853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550320
15	NC_011564	AGTA	2	8	895	902	50 %	25 %	25 %	0 %	212550320
16	NC_011564	AAG	2	6	988	993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550320
17	NC_011564	AGA	2	6	1047	1052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550320
18	NC_011564	CAG	2	6	1093	1098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550320
19	NC_011564	TCA	2	6	1113	1118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550320
20	NC_011564	ATT	2	6	1151	1156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550320
21	NC_011564	GAA	2	6	1171	1176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550320
22	NC_011564	TAA	2	6	1248	1253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550320
23	NC_011564	GGATAA	2	12	1254	1265	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	212550320
24	NC_011564	A	6	6	1283	1288	100 %	0 %	0 %	0 %	212550320
25	NC_011564	GAAA	2	8	1319	1326	75 %	0 %	25 %	0 %	212550320
26	NC_011564	GCT	2	6	1336	1341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212550320
27	NC_011564	ACT	2	6	1348	1353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550320
28	NC_011564	AGG	2	6	1406	1411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212550320
29	NC_011564	GGA	2	6	1422	1427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212550320
30	NC_011564	ATCAAG	2	12	1466	1477	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	212550320
31	NC_011564	GTC	2	6	1524	1529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212550320
32	NC_011564	TA	3	6	1531	1536	50 %	50 %	0 %	0 %	212550320
33	NC_011564	AAG	2	6	1576	1581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550320
34	NC_011564	A	6	6	1660	1665	100 %	0 %	0 %	0 %	212550321
35	NC_011564	TTATT	2	10	1676	1685	20 %	80 %	0 %	0 %	212550321
36	NC_011564	GGAGCT	2	12	1702	1713	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	212550321
37	NC_011564	TGA	2	6	1734	1739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550321
38	NC_011564	CTA	2	6	1752	1757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550321
39	NC_011564	GA	3	6	1814	1819	50 %	0 %	50 %	0 %	212550321
40	NC_011564	TGG	2	6	1849	1854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212550321
41	NC_011564	TGG	2	6	1872	1877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212550321
42	NC_011564	GAA	3	9	1908	1916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550321
43	NC_011564	AAG	2	6	1947	1952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550321
44	NC_011564	AAGA	2	8	1975	1982	75 %	0 %	25 %	0 %	212550321
45	NC_011564	GATA	2	8	1983	1990	50 %	25 %	25 %	0 %	212550321
46	NC_011564	A	6	6	1998	2003	100 %	0 %	0 %	0 %	212550321
47	NC_011564	AGA	2	6	2028	2033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550321
48	NC_011564	TGA	2	6	2046	2051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550321
49	NC_011564	AATT	2	8	2058	2065	50 %	50 %	0 %	0 %	212550321
50	NC_011564	ACA	2	6	2132	2137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550322
51	NC_011564	ATT	2	6	2187	2192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550322
52	NC_011564	T	6	6	2191	2196	0 %	100 %	0 %	0 %	212550322
53	NC_011564	GA	3	6	2215	2220	50 %	0 %	50 %	0 %	212550322
54	NC_011564	AT	3	6	2227	2232	50 %	50 %	0 %	0 %	212550322
55	NC_011564	TGA	2	6	2269	2274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550322
56	NC_011564	AGA	2	6	2362	2367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550322
57	NC_011564	TATAGG	2	12	2398	2409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550322
58	NC_011564	GAA	2	6	2459	2464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550322
59	NC_011564	AGA	2	6	2492	2497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550322
60	NC_011564	GA	3	6	2496	2501	50 %	0 %	50 %	0 %	212550322
61	NC_011564	AAT	2	6	2546	2551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550322
62	NC_011564	TAGT	2	8	2577	2584	25 %	50 %	25 %	0 %	212550322
63	NC_011564	ATA	2	6	2613	2618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550322
64	NC_011564	TAA	2	6	2662	2667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550322
65	NC_011564	CCA	2	6	2727	2732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212550322
66	NC_011564	AT	3	6	2733	2738	50 %	50 %	0 %	0 %	212550322
67	NC_011564	TATT	2	8	2984	2991	25 %	75 %	0 %	0 %	212550322
68	NC_011564	AATTAC	2	12	3050	3061	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	212550322
69	NC_011564	AGATAT	2	12	3062	3073	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	212550322
70	NC_011564	GGAA	2	8	3165	3172	50 %	0 %	50 %	0 %	212550323
71	NC_011564	GACA	2	8	3269	3276	50 %	0 %	25 %	25 %	212550323
72	NC_011564	CAC	2	6	3287	3292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212550323
73	NC_011564	AGC	2	6	3308	3313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550323
74	NC_011564	GATG	2	8	3343	3350	25 %	25 %	50 %	0 %	212550323
75	NC_011564	TAA	2	6	3352	3357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550323
76	NC_011564	TTC	2	6	3363	3368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550323
77	NC_011564	TCT	2	6	3372	3377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550323
78	NC_011564	AGA	2	6	3511	3516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550323
79	NC_011564	AG	3	6	3619	3624	50 %	0 %	50 %	0 %	212550323
80	NC_011564	GAA	2	6	3632	3637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550323
81	NC_011564	AGAT	2	8	3720	3727	50 %	25 %	25 %	0 %	212550323
82	NC_011564	CTAC	2	8	3746	3753	25 %	25 %	0 %	50 %	212550323
83	NC_011564	AATGC	2	10	3758	3767	40 %	20 %	20 %	20 %	212550323
84	NC_011564	AGGA	2	8	3786	3793	50 %	0 %	50 %	0 %	212550323
85	NC_011564	CAA	2	6	3798	3803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550323
86	NC_011564	TGGATG	2	12	3859	3870	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	212550323
87	NC_011564	AAG	2	6	3879	3884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550323
88	NC_011564	A	6	6	3890	3895	100 %	0 %	0 %	0 %	212550323
89	NC_011564	GAA	3	9	3911	3919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550323
90	NC_011564	AAAT	2	8	3920	3927	75 %	25 %	0 %	0 %	212550323
91	NC_011564	A	7	7	4646	4652	100 %	0 %	0 %	0 %	212550324
92	NC_011564	TCAT	2	8	4661	4668	25 %	50 %	0 %	25 %	212550324
93	NC_011564	CAA	2	6	4712	4717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550324
94	NC_011564	T	6	6	4757	4762	0 %	100 %	0 %	0 %	212550324
95	NC_011564	T	6	6	4765	4770	0 %	100 %	0 %	0 %	212550324
96	NC_011564	AGATGT	2	12	4792	4803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550324
97	NC_011564	TCAA	2	8	4822	4829	50 %	25 %	0 %	25 %	212550324
98	NC_011564	TCA	2	6	4851	4856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550324
99	NC_011564	A	6	6	4871	4876	100 %	0 %	0 %	0 %	212550324
100	NC_011564	AAT	2	6	4907	4912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550324
101	NC_011564	A	7	7	5005	5011	100 %	0 %	0 %	0 %	212550325
102	NC_011564	AACA	2	8	5072	5079	75 %	0 %	0 %	25 %	212550325
103	NC_011564	GAA	2	6	5089	5094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550325
104	NC_011564	AAT	2	6	5119	5124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550325
105	NC_011564	ATTA	2	8	5152	5159	50 %	50 %	0 %	0 %	212550325
106	NC_011564	AGA	2	6	5695	5700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550326
107	NC_011564	TCAA	2	8	5871	5878	50 %	25 %	0 %	25 %	212550326
108	NC_011564	AT	3	6	5894	5899	50 %	50 %	0 %	0 %	212550326
109	NC_011564	TTC	2	6	5908	5913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550326
110	NC_011564	TTC	2	6	5918	5923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550326
111	NC_011564	TGA	2	6	5932	5937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550326
112	NC_011564	CAT	2	6	5952	5957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550326
113	NC_011564	A	7	7	5994	6000	100 %	0 %	0 %	0 %	212550326
114	NC_011564	TTA	2	6	6043	6048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550326
115	NC_011564	AAAT	2	8	6269	6276	75 %	25 %	0 %	0 %	212550326
116	NC_011564	TGT	2	6	6305	6310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550326
117	NC_011564	AGG	2	6	6398	6403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212550326
118	NC_011564	GAA	2	6	6407	6412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550326
119	NC_011564	GTT	2	6	6495	6500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550326
120	NC_011564	AGC	2	6	6526	6531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550326
121	NC_011564	AGTA	2	8	6573	6580	50 %	25 %	25 %	0 %	212550326
122	NC_011564	AAG	2	6	6666	6671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550326
123	NC_011564	AGA	2	6	6725	6730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550326
124	NC_011564	CAG	2	6	6771	6776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550326
125	NC_011564	TCA	2	6	6791	6796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550326
126	NC_011564	ATT	2	6	6829	6834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550326
127	NC_011564	GAA	2	6	6849	6854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550326
128	NC_011564	TAA	2	6	6926	6931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550326
129	NC_011564	GGATAA	2	12	6932	6943	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	212550326
130	NC_011564	A	6	6	6961	6966	100 %	0 %	0 %	0 %	212550326
131	NC_011564	GAAA	2	8	6997	7004	75 %	0 %	25 %	0 %	212550326
132	NC_011564	GCT	2	6	7014	7019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212550326
133	NC_011564	ACT	2	6	7026	7031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550326
134	NC_011564	AGG	2	6	7084	7089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212550326
135	NC_011564	GGA	2	6	7100	7105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212550326
136	NC_011564	ATCAAG	2	12	7144	7155	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	212550326
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267	NC_011564	ATT	2	6	18448	18453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550337
268	NC_011564	TCT	2	6	18478	18483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550337
269	NC_011564	CTA	2	6	18566	18571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550337
270	NC_011564	TTA	2	6	18590	18595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550337
271	NC_011564	CAGT	2	8	18596	18603	25 %	25 %	25 %	25 %	212550337
272	NC_011564	CTT	2	6	18676	18681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550337
273	NC_011564	AAT	2	6	18755	18760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550337
274	NC_011564	ATT	2	6	18799	18804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550337
275	NC_011564	TTC	2	6	18820	18825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550337
276	NC_011564	CATTC	2	10	18834	18843	20 %	40 %	0 %	40 %	212550337
277	NC_011564	TAT	2	6	18855	18860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550337
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279	NC_011564	T	7	7	18951	18957	0 %	100 %	0 %	0 %	212550337
280	NC_011564	CTAC	2	8	18986	18993	25 %	25 %	0 %	50 %	212550337
281	NC_011564	TCA	2	6	19004	19009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550337
282	NC_011564	CTT	2	6	19101	19106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550337
283	NC_011564	CTT	2	6	19143	19148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550337
284	NC_011564	TC	3	6	19199	19204	0 %	50 %	0 %	50 %	212550337
285	NC_011564	T	6	6	19225	19230	0 %	100 %	0 %	0 %	212550337
286	NC_011564	CAAT	2	8	19328	19335	50 %	25 %	0 %	25 %	212550337
287	NC_011564	ATC	2	6	19357	19362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550337
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289	NC_011564	GTT	2	6	19432	19437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550337
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292	NC_011564	T	6	6	19541	19546	0 %	100 %	0 %	0 %	212550337
293	NC_011564	CT	3	6	19573	19578	0 %	50 %	0 %	50 %	212550337
294	NC_011564	GTA	2	6	19592	19597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550337
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381	NC_011564	ATA	2	6	26591	26596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550347
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384	NC_011564	TA	3	6	27612	27617	50 %	50 %	0 %	0 %	212550348
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393	NC_011564	TCCT	2	8	28011	28018	0 %	50 %	0 %	50 %	212550349
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395	NC_011564	AATG	2	8	28025	28032	50 %	25 %	25 %	0 %	212550349
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